Biometrie für Biologen
Inhaltsverzeichnis:
- Einführung und Organisatorisches
- Grundlagen der Programmiersprache R
- Wiederholung der Grundlagen Biostatistik
- Statistische Tests
- Regression
- Methodik biomedizinischer und klinischer Studien
- Überlebenszeit-Analysen
- Auswertung hochdimensionaler biomedizinscher Daten
- Maschinelle Lernverfahren in der Biometrie
- Deep Sequencing / Sequenzbioinformatik
- Netzwerk-Bioinformatik
Dozent
Prof. Dr. Lars Kaderali
Institut für Bioinformatik
Ort und Zeit:
- Vorlesung: Donnerstag, 10:00 bis 11:30, Hörsaal Rubenowstr. 3 (EG)
- Übung: Freitag, 12:15 bis 13:45 sowie Montag, 17:00-18:30 im PC-Pool des Instituts, Raum 1.01 und 2.01, Walter-Rathenau-Str. 11
Übungen und Klausur:
Zum Bestehen der Übungen sind 3/4 der Übungen zu besuchen (maximal 3 Fehltermine).
Die Klausur findet statt am 30.1.2025, 10:00 Uhr; genauere Informationen werden noch rechtzeitig bekanntgegeben.
Bitte bringen Sie zur Klausur Ihren Personalausweis und Studentenausweis mit.
Klausureinsicht: Während der Öffnungszeiten des Sekretariats des Instituts im C_FunGene Gebäude.
Die Nachklausur findet vor Beginn des Sommersemesters statt.
Folien und Materialien zu Vorlesung
Folien, Übungsblätter sowie weitere Materialien zur Vorlesung werden Ihnen hier parallel zur Veranstaltung zur Verfügung gestellt.
DISCORD-Kanal zur Lehrveranstaltung: [link]
Vorlesung
- Vorlesung – Organisatorisches und Kurzeinführung in R [pdf] [video]
- Vorlesung – Wiederholung Grundlagen der Biostatistik [pdf] [video]
- Vorlesung – Statistische Tests [pdf] [video]
- Vorlesung – Regression [pdf] [video]
- Vorlesung – Klinische Studien [pdf][video]
Übung
- Informationen für die Übungen
- 1. Übung
- Jupyter Notebook (1_indroduction.ipynb)
- 2. Übung
- Jupyter Notebook (2_Variables.ipynb)
- Übung am 1.11.24 – entfällt auf Grund des Brückentages
- 3. Übung
- Jupyter Notebook (3_descrstat.ipynb)
- Datensatz zum Notebook 3 (daten_grabe.Rda)
- 4. Übung
- Jupyter Notebook (4_inferential_statistics.ipynb)
- Datensatz zum Notebook 4 (daten_grabe.Rda)
- 5. Übung
- Jupyter Notebook (5_regression.ipynb)
- Datensatz zum Notebook 5 (data-pregnancy.csv)