Biometrie für Biomathematiker
Inhaltsverzeichnis:
- Einführung, Wiederholung: Grundlagen der Biostatistik
- Methodik biomedizinischer und klinischer Studien
- Überlebenszeitanalysen, prädiktive Modelle der personalisierten Medizin
- Auswertung hochdimensionaler biomedizinscher Daten
- Maschinelle Lernverfahren in der Biometrie
- Deterministische und Stochastische Modelle der Systembiologie
- Parameterschätzung und Identifizierbarkeit
- Anwendungsbeispiel der Systembiologie
Ort und Zeit:
- Vorlesung: Mittwoch 10:15 bis 11:45, Raum 1.01, Walther-Rathenau-Str. 11
- Übung: Donnerstag, 14:00 bis 15:30, Raum 1.01, Walther-Rathenau-Str. 11
Übungen und Klausur:
Zum Bestehen der Übungen sind 3/4 der Übungen zu besuchen (maximal 3 Fehltermine).
Die Klausur findet statt am 29. Januar 2025, 10:15 Uhr in Raum 1.01, Walther-Rathenau-Str. 11
Bitte bringen Sie zur Klausur Ihren Personalausweis und Studentenausweis mit.
Klausureinsicht: Während der Öffnungszeiten des Sekretariats des Instituts im C_FunGene Gebäude.
Die Nachklausur findet als mündliche Prüfung nach individueller Vereinbarung vor Beginn des Sommersemesters statt.
Folien und Materialien zur Vorlesung:
Folien, Übungsblätter sowie in den Übungen verwendete Materialien stellen wir Ihnen hier parallel zur Veranstaltung zum Download zur Verfügung.
DISCORD-Kanal zur Vorlesung: [link]
Materialien zur Vorlesung
- Vorlesung – Einführung und klinische Studien [pdf]
- Vorlesung – Überlebenszeitanalysen Teil 1 [pdf]
- Vorlesung – Überlebenszeitanalysen Teil 2 [pdf]
- Vorlesung – Deep Sequencing [pdf]
- Vorlesung – Geneset Enrichment und Dimensionsreduktion [pdf]
- Vorlesung – Unüberwachte maschinelle Lernverfahren [pdf]
- Vorlesung – Überwachte maschinelle Lernverfahren [pdf]
Herleitung der Support Vector Machine [pdf] - Vorlesung – Neuronale Netze und Deep Learning [pdf]
- Vorlesung – Netzwerkinferenz und Bayes’sche Netze [pdf]
Matierialen zur Übung
R Referenzkarte [pdf]
- Übung
- Übungsblatt [pdf]
- Datensatz zum 1. Übungsblatt [handouts1-data.csv]
- Übungslösungen[Ex1.R]
- Übung
- Übungsblatt [exercise_2.pdf]
- Datensatz zum 2. Übungsblatt [handouts1-data.csv]
- Übungslösungen [Ex2.R]
- Übung
- Übungsblatt [exercise_3.pdf]
- Datensatz zum 3. Übungsblatt [handouts3-data-pregnancy.csv]
- Slides[Ex3_slides.pdf]
- Übung
- Übungsblatt [exercise_4.pdf]
- Datensatz zum 4. Übungsblatt [athletes.txt]
- Datensatz zum 4. Hausaufgaben [handouts4-data-leukemia.csv]
- Übung
- Übungsblatt [exercise_5.pdf]
- Script [bash_script.sh]
- Übung
- Übungsblatt [exercise_6.pdf]
- Script_suppl [exercise_6.R]
- Scipt_suppl1 [exercise_6_supp.R]
- Scipt_suppl2 [exercise_6_supp_2.R]
- Datensatz zum 6.a Übungsblatt [GSE246053_annot.txt]
- Datensatz zum 6.b Übungsblatt [GSE246053_counts.txt]
- Datensatz zum 6.c Übungsblatt [Mm.c2.all.v7.1.entrez.rds]
- Slides1 [Ex6_slides.pdf]
- Slides2 [Ex6_slides_2.pdf]
- Übung
- Übungsblatt [exercise_7.pdf]
- Scipt_main [exercise_7_supp.R]
- Script_suppl [exercise_7.R]
- Slides [Ex7_slides.pdf]