Inhaltsverzeichnis:

1. Einführung, Wiederholung: Grundlagen der Biostatistik
2. Methodik biomedizinischer und klinischer Studien
3. Überlebenszeitanalysen, prädiktive Modelle der personalisierten Medizin
4. Auswertung hochdimensionaler biomedizinscher Daten
5. Maschinelle Lernverfahren in der Biometrie
6. Deterministische und Stochastische Modelle der Systembiologie
7. Parameterschätzung und Identifizierbarkeit
8. Anwendungsbeispiel der Systembiologie

Ort und Zeit:

• Vorlesung: Mittwoch 10:15 bis 11:45, Raum 1.01, Walther-Rathenau-Str. 11
• Übung: Donnerstag, 14:00 bis 15:30, Raum 1.01, Walther-Rathenau-Str. 11

Übungen und Klausur:

Zum Bestehen der Übungen sind 3/4 der Übungen zu besuchen (maximal 3 Fehltermine).

Die Klausur findet statt am 29. Januar 2025, 10:15 Uhr in Raum 1.01, Walther-Rathenau-Str. 11

Bitte bringen Sie zur Klausur Ihren Personalausweis und Studentenausweis mit.

Klausureinsicht: Während der Öffnungszeiten des Sekretariats des Instituts im C_FunGene Gebäude.

Die Nachklausur findet als mündliche Prüfung nach individueller Vereinbarung vor Beginn des Sommersemesters statt.

Folien und Materialien zur Vorlesung:

Folien, Übungsblätter sowie in den Übungen verwendete Materialien stellen wir Ihnen hier parallel zur Veranstaltung zum Download zur Verfügung.

DISCORD-Kanal zur Vorlesung: [link]

Materialien zur Vorlesung

1. Vorlesung – Einführung und klinische Studien [pdf]
2. Vorlesung – Überlebenszeitanalysen Teil 1 [pdf]
3. Vorlesung – Überlebenszeitanalysen Teil 2 [pdf]
4. Vorlesung – Deep Sequencing [pdf]
5. Vorlesung – Geneset Enrichment und Dimensionsreduktion [pdf]
6. Vorlesung – Unüberwachte maschinelle Lernverfahren [pdf]
7. Vorlesung – Überwachte maschinelle Lernverfahren [pdf]
   Herleitung der Support Vector Machine [pdf]
8. Vorlesung – Neuronale Netze und Deep Learning [pdf]
9. Vorlesung – Netzwerkinferenz und Bayes’sche Netze [pdf]

Matierialen zur Übung

R Referenzkarte [pdf]

1. Übung
   • Übungsblatt [pdf]
   • Datensatz zum 1. Übungsblatt [handouts1-data.csv]
   • Übungslösungen[Ex1.R]
2. Übung
   • Übungsblatt [exercise_2.pdf]
   • Datensatz zum 2. Übungsblatt [handouts1-data.csv]
   • Übungslösungen [Ex2.R]
3. Übung
   • Übungsblatt [exercise_3.pdf]
   • Datensatz zum 3. Übungsblatt [handouts3-data-pregnancy.csv]
   • Slides[Ex3_slides.pdf]
4. Übung
   • Übungsblatt [exercise_4.pdf]
   • Datensatz zum 4. Übungsblatt [athletes.txt]
   • Datensatz zum 4. Hausaufgaben [handouts4-data-leukemia.csv]
5. Übung
   • Übungsblatt [exercise_5.pdf]
   • Script [bash_script.sh]
6. Übung
   • Übungsblatt [exercise_6.pdf]
   • Script_suppl [exercise_6.R]
   • Scipt_suppl1 [exercise_6_supp.R]
   • Scipt_suppl2 [exercise_6_supp_2.R]
   • Datensatz zum 6.a Übungsblatt [GSE246053_annot.txt]
   • Datensatz zum 6.b Übungsblatt [GSE246053_counts.txt]
   • Datensatz zum 6.c Übungsblatt [Mm.c2.all.v7.1.entrez.rds]
   • Slides1 [Ex6_slides.pdf]
   • Slides2 [Ex6_slides_2.pdf]
7. Übung
   • Übungsblatt [exercise_7.pdf]
   • Scipt_main [exercise_7_supp.R]
   • Script_suppl [exercise_7.R]
   • Slides [Ex7_slides.pdf]